Ban Quản lý các KCN tỉnh Nam Định được thành lập năm 2003 tại Quyết định số 238/2003/QĐ-TTg ngày 13/11/2003 về việc thành lập Ban Quản lý các KCN tỉnh Nam Định, được giao nhiệm vụ quản lý nhà nước trực tiếp đối với các Khu công nghiệp trên địa bàn tỉnh, tiền thân là Ban Quản lý xây dựng hạ tầng KCN tỉnh Nam Định, với chức năng, nhiệm vụ được giao là đầu tư cơ sở hạ tầng và quản lý nhà nước đối với KCN phía Tây thành phố Nam Định (nay là KCN Hoà Xá ) (Quyết định số 2806/2001/QĐ-UB ngày 29/11/2001 của UBND tỉnh Nam Định).

Đến nay, tổng số công chức, viên chức, người lao động của Ban là hơn 70 người (trong đó biên chế được giao gồm: 24 công chức, 27 viên chức, 04 lao động hợp đồng theo Nghị định 161/2018/NĐ-CP và lao động hợp đồng), Đảng bộ có 45 Đảng viên, bộ máy gồm 03 phòng chức năng là Văn phòng Ban, Phòng Quản lý Đầu tư - Quy hoạch - Xây dựng, Phòng Quản lý Doanh nghiệp - Tài nguyên và Môi trường và 01 đơn vị sự nghiệp công lập là Trung tâm phát triển hạ tầng và tư vấn đầu tư Khu công nghiệp.